Научный центр мирового уровня (НЦМУ) «Передовые цифровые технологии» создан в рамках Национального проекта «Наука» в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 7 мая 2018 г. № 204. Деятельность Центра осуществляется за счет средств гранта в форме субсидий из федерального бюджета на осуществление государственной поддержки создания и развития научных центров мирового уровня, включая международные математические центры мирового уровня, центры геномных исследований мирового уровня, а также научные центры мирового уровня, выполняющие исследования и разработки по приоритетам научно-технологического развития Российской Федерации (Постановление Правительства Российской Федерации от 30 апреля 2019 года № 538 «О мерах государственной поддержки создания и развития научных центров мирового уровня»).
НЦМУ «Передовые цифровые технологии» функционирует в форме консорциума четырех организаций, в их числе: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого (инициатор и координатор консорциума), Санкт-Петербургский государственный морской технический университет, Тюменский государственный университет, НИИ гриппа имени А.А. Смородинцева Минздрава России.